水泥基腻子和石膏基腻子各有其优点和适用情况，没有绝对的“好”或“不好”，选择哪种取决于具体需求和条件。

水泥基腻子具有高强度、硬度和良好的耐水性。它的干固时间相对较慢，属于水干型胶凝材料。此外，水泥基腻子比较脆，容易开裂。

石膏基腻子则具有良好的硬度以及一般的耐水性。它具有粘结性能，与其它腻子相比不含胶水，更加环保。石膏基腻子属于气硬型胶凝材料，不会受天气影响，干固速度快，手感好，易施工。

石膏基腻子和石膏基抹灰在以下三个方面存在差异：

1.用途：抹灰石膏主要用于墙壁、天花板等建筑表面的抹平、磨光和涂装前的基础处理，它具有良好的粘结性和抗裂性。而腻子则通常用于涂装前，填补和平滑墙面缺陷。

2.外观：石膏基腻子是细腻的白色粉末，由石膏和其他添加剂混合而成，通常用于室内墙面和天花板的找平和修补。而石膏基抹灰的外观更像砂浆，其颜色可能因混合的材料不同而有所差异，主要用于室外墙面和地面的找平和保护。

3.施工特性：石膏基腻子的施工性较好，易于操作，且干燥后表面光滑，易于打磨和涂装。而石膏基抹灰的施工性相对较差，需要较高的技能才能施工出平整的表面，干燥后表面较粗糙，需要打磨后才能涂装。

综上所述，如果需要高强度、硬度和良好的耐水性，可以选择水泥基腻子；如果需要粘结性能好、环保且易施工，可以选择石膏基腻子。